MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Aeropyrum camini SY1 = JCM 12091 DNA

Total Repeats: 3665

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022521	GGC	2	6	449478	449483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_022521	G	6	6	449736	449741	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_022521	CGC	2	6	449752	449757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1004	NC_022521	CAG	2	6	449765	449770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_022521	AGG	2	6	452228	452233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_022521	C	7	7	452242	452248	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1007	NC_022521	AGG	2	6	452259	452264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_022521	AGG	2	6	452632	452637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_022521	AGCC	2	8	455443	455450	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1010	NC_022521	TA	3	6	455560	455565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_022521	GAT	2	6	455571	455576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_022521	AAAC	2	8	455579	455586	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1013	NC_022521	G	6	6	455649	455654	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_022521	TGT	2	6	455655	455660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_022521	GCG	2	6	455664	455669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_022521	G	6	6	455705	455710	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_022521	GCG	2	6	455817	455822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_022521	CGG	2	6	455849	455854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_022521	C	6	6	455874	455879	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1020	NC_022521	CG	3	6	455886	455891	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1021	NC_022521	CCG	2	6	455917	455922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1022	NC_022521	GGC	2	6	455925	455930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_022521	TGC	2	6	455965	455970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_022521	GGC	2	6	455985	455990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_022521	GCC	2	6	456130	456135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1026	NC_022521	GCC	2	6	456143	456148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1027	NC_022521	G	7	7	456174	456180	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_022521	ATT	2	6	457241	457246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_022521	GGGC	2	8	457280	457287	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1030	NC_022521	C	6	6	457329	457334	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1031	NC_022521	TGC	2	6	458069	458074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_022521	TGG	2	6	458079	458084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_022521	CCA	2	6	460257	460262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1034	NC_022521	TAA	2	6	460290	460295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_022521	CGG	2	6	463671	463676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_022521	TAT	3	9	463695	463703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_022521	CCA	2	6	464071	464076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1038	NC_022521	GAC	2	6	464123	464128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_022521	GGGA	2	8	464152	464159	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_022521	GAG	2	6	464175	464180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_022521	AGCCC	2	10	466000	466009	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1042	NC_022521	GGA	2	6	466034	466039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_022521	GTGG	2	8	466044	466051	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_022521	CCGG	2	8	466056	466063	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1045	NC_022521	CGG	2	6	466240	466245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_022521	CGG	2	6	466722	466727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_022521	GGC	2	6	467086	467091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_022521	C	6	6	468003	468008	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1049	NC_022521	AATT	2	8	468034	468041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_022521	AGC	2	6	468053	468058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_022521	C	6	6	468290	468295	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1052	NC_022521	CGC	2	6	469479	469484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1053	NC_022521	TATAG	2	10	469514	469523	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_022521	CAA	2	6	470839	470844	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_022521	TAT	2	6	470845	470850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_022521	CGG	2	6	472211	472216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_022521	TGGC	2	8	472260	472267	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1058	NC_022521	TG	3	6	472280	472285	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_022521	TAT	2	6	472288	472293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_022521	AAG	2	6	475678	475683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_022521	ACCCCC	2	12	477134	477145	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
1062	NC_022521	G	6	6	477157	477162	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_022521	GAA	2	6	477173	477178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_022521	AGA	2	6	477195	477200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_022521	GCG	2	6	477223	477228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_022521	GAC	2	6	477286	477291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_022521	CGC	2	6	477292	477297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1068	NC_022521	CCAGC	2	10	477346	477355	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1069	NC_022521	TCC	2	6	477394	477399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1070	NC_022521	CTGG	2	8	477443	477450	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1071	NC_022521	GCC	2	6	477916	477921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_022521	C	7	7	479105	479111	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1073	NC_022521	GGC	2	6	480856	480861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_022521	TCG	3	9	480963	480971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_022521	CGG	2	6	481006	481011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_022521	GTG	2	6	481198	481203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_022521	GCA	2	6	485709	485714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_022521	ATC	2	6	485754	485759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_022521	AAT	2	6	485762	485767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_022521	G	6	6	485775	485780	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_022521	GAG	2	6	485814	485819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_022521	C	6	6	485836	485841	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1083	NC_022521	GCC	2	6	487473	487478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1084	NC_022521	G	6	6	487566	487571	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_022521	GCCC	2	8	487613	487620	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1086	NC_022521	CGC	2	6	487690	487695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1087	NC_022521	GGT	2	6	487729	487734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_022521	TAA	2	6	489488	489493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_022521	TTTA	2	8	489532	489539	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_022521	ACC	2	6	489895	489900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1091	NC_022521	TAA	2	6	489938	489943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_022521	CAA	2	6	489950	489955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_022521	TATT	2	8	489956	489963	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_022521	TA	4	8	490002	490009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_022521	TA	3	6	490015	490020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_022521	C	6	6	490055	490060	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1097	NC_022521	GGA	2	6	490099	490104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_022521	CAGG	2	8	490114	490121	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1099	NC_022521	GCG	3	9	490135	490143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_022521	CCT	3	9	490173	490181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1101	NC_022521	GAG	2	6	490209	490214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_022521	TCC	2	6	490215	490220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_022521	ACT	2	6	490266	490271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_022521	GCG	2	6	490574	490579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_022521	GCG	2	6	490585	490590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_022521	CAC	2	6	493429	493434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1107	NC_022521	CCG	2	6	495479	495484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1108	NC_022521	GAG	2	6	497253	497258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_022521	C	6	6	497304	497309	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1110	NC_022521	C	6	6	497311	497316	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1111	NC_022521	G	7	7	497326	497332	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_022521	TAA	2	6	499351	499356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_022521	GTG	2	6	501127	501132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_022521	CTG	2	6	501156	501161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_022521	ACT	2	6	501167	501172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_022521	GT	3	6	501193	501198	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_022521	CA	3	6	501212	501217	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1118	NC_022521	TAAC	2	8	502793	502800	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1119	NC_022521	CCT	2	6	502802	502807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_022521	GAG	2	6	502815	502820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_022521	G	6	6	502828	502833	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_022521	GT	3	6	502856	502861	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_022521	TA	3	6	502867	502872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_022521	TG	4	8	502873	502880	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_022521	TCC	2	6	503642	503647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1126	NC_022521	TG	3	6	503748	503753	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_022521	AGG	2	6	503759	503764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_022521	GA	3	6	503779	503784	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_022521	TA	3	6	503790	503795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_022521	CT	3	6	503823	503828	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1131	NC_022521	GGTATT	2	12	503850	503861	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_022521	ATCTA	2	10	504303	504312	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1133	NC_022521	ATA	2	6	504321	504326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_022521	AAT	2	6	504372	504377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1135	NC_022521	AT	3	6	505408	505413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_022521	AG	3	6	505447	505452	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_022521	G	6	6	505467	505472	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_022521	CA	3	6	506576	506581	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1139	NC_022521	G	6	6	506612	506617	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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1142	NC_022521	A	6	6	506752	506757	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1143	NC_022521	CCT	2	6	506815	506820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1252	NC_022521	TGACCT	2	12	543944	543955	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1262	NC_022521	ATA	2	6	550550	550555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1263	NC_022521	AT	3	6	550572	550577	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1264	NC_022521	GAA	2	6	552996	553001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1265	NC_022521	AGG	2	6	553005	553010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1266	NC_022521	CTA	2	6	553029	553034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1267	NC_022521	ATTAT	2	10	553103	553112	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1268	NC_022521	GGGT	2	8	553114	553121	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1269	NC_022521	GCT	2	6	554255	554260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1270	NC_022521	CTC	2	6	554275	554280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1271	NC_022521	CCTC	2	8	554295	554302	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1272	NC_022521	TCC	2	6	554330	554335	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1273	NC_022521	AC	3	6	554415	554420	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1413	NC_022521	TGA	2	6	621611	621616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1414	NC_022521	TTAA	2	8	621638	621645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1415	NC_022521	ATG	2	6	621661	621666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1416	NC_022521	ATG	2	6	621668	621673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1417	NC_022521	TAAATA	2	12	621688	621699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1418	NC_022521	CAC	2	6	622223	622228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1419	NC_022521	T	6	6	622251	622256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1420	NC_022521	GTG	2	6	626188	626193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1421	NC_022521	CCG	2	6	626220	626225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1422	NC_022521	CAG	2	6	627190	627195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1423	NC_022521	GCT	2	6	627219	627224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1424	NC_022521	AGG	2	6	627226	627231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1425	NC_022521	C	6	6	629960	629965	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1426	NC_022521	ACC	2	6	631157	631162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1427	NC_022521	ACAA	2	8	631219	631226	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1428	NC_022521	TA	3	6	631244	631249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1429	NC_022521	TGG	2	6	631256	631261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1430	NC_022521	GT	3	6	632928	632933	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1431	NC_022521	GTG	2	6	632937	632942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1432	NC_022521	TCC	2	6	632945	632950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1433	NC_022521	CCATTA	2	12	634579	634590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1434	NC_022521	TA	3	6	634589	634594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1435	NC_022521	GTT	2	6	634602	634607	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1436	NC_022521	TTA	2	6	634697	634702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1437	NC_022521	GGA	2	6	634706	634711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1438	NC_022521	AAT	2	6	634732	634737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1439	NC_022521	GCC	2	6	634777	634782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1440	NC_022521	CGG	2	6	635592	635597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1442	NC_022521	AT	4	8	636761	636768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1443	NC_022521	TA	3	6	636799	636804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1444	NC_022521	TGG	2	6	636808	636813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1445	NC_022521	GAC	2	6	637685	637690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1446	NC_022521	G	6	6	640906	640911	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1447	NC_022521	C	6	6	640952	640957	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1448	NC_022521	G	6	6	640958	640963	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1449	NC_022521	C	6	6	641694	641699	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1450	NC_022521	TGG	2	6	641717	641722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1451	NC_022521	GGA	2	6	641735	641740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1452	NC_022521	CTC	3	9	641779	641787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1453	NC_022521	GGGCT	2	10	641802	641811	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1454	NC_022521	GTC	2	6	641828	641833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1456	NC_022521	CCT	2	6	643417	643422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1457	NC_022521	CAC	2	6	644007	644012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1458	NC_022521	TAT	2	6	644015	644020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1461	NC_022521	AC	3	6	645059	645064	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1462	NC_022521	C	6	6	645075	645080	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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1471	NC_022521	CCT	2	6	649583	649588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1472	NC_022521	C	6	6	649590	649595	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1473	NC_022521	CTC	2	6	649604	649609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1485	NC_022521	TG	3	6	650539	650544	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1492	NC_022521	G	6	6	653102	653107	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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1495	NC_022521	TGGG	2	8	654034	654041	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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